Gemäss Legenden geht der Ursprung des Larimars zurück auf Atlantis. Danach soll der Larimar das letzte Überbleibsel der versunkenen Stadt sein.

Viele Menschen glauben, dass Atlantis in der Region versunken liegt, wo der Heilstein herkommt. Deshalb bezeichnet man den Larimar auch als Atlantisstein. Diverse Geschichten, Mythen und Legenden weisen auf eine sehr enge Verbindung zwischen dem Stein und der heiligen Stadt hin. So erzählen griechische Überlieferungen von einem Volk, welches heilende blaue Steine habe und als Bewohner des Inselstaates Atlantis bezeichnet wird.

Ausserdem hat Edgar Cayce (1877 - 1945) ein US-amerikanisches Medium, auch bekannt als der ‚schlafende Prophet’, auf die Verbindung zwischen Atlantis und dem Larimar hingewiesen. Er begab sich zwischen 1901 und 1944 immer wieder in Trance, wobei er Antworten zu Fragen über Themen wie Gesundheit, Astrologie, Reinkarnation und auch Atlantis gab. Über Atlantis äusserte sich Cayce, dass es einen blauen Stein gäbe, der atlantischen Ursprungs und auf einer Insel in der Karibik zu finden sei. Dieser Stein soll nach Cayce heilende Kräfte besitzen.